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南京大學深圳研究院是南京大學為推進區域科技經濟發展、服務社會于2000年經深圳市人民政府批準，在深圳獨立開辦的集產、學、研、資、介于一體的高層次人才培養、科技開發及成果轉化的事業法人單位，是南京大學人才培養、成果轉化及技術轉移、技術研發與科技創新在珠三角地區的延伸。　 深圳研究院依托南京大學雄厚的科研實力和優質的教育資源，集成社會資源，在人才培養、科技進步、社會和諧、科學發展方面堅持以服務為宗旨，在貢獻中發展，在研發、教育、成果孵化、基礎建設等各項工作都取得了長足進步，為深圳建設國家創新型城市提供人才支撐和智力支持。連年被政府部門評為**研究院。　　研究院開辦有研究生課程班、遠程網絡教育、職業資格培訓、企業訂單培訓、公務員培訓，舉辦院士報告、專家講座、專業技術論壇等，建立了多層次人才培訓平臺。在新材料、電子信息、生物醫藥、精細化工和資源環境領域中進行成果轉化及技術轉移，成效顯著。設有南京大學近代聲學教育部重點實驗室深圳研發中心、南京大學計算機軟件工程中心深圳研發中心、深圳市輿情調查與危機管理研究中心、、國家有機毒物污染控制與資源化工程技術研究中心深圳分中心（國家環境保護有機化工廢水處理與資源化工程技術中心深圳研發中心）等科研機構和專業服務平臺，承擔多項各級科技計劃項目，舉辦多屆國際性學術會議。　 在深圳市高新區擁有約3.5萬平方米建筑規模的南京大學深圳產學研基地，通過引進南京大學的原創性成果，促進與深圳業界合作，利用深圳的政策、資金、市場等資源轉化科技成果，努力成為新技術、新產品和新企業的源泉。重點在電子通信、物聯網、聲學、環保、計算機軟件領域創新模式做出特色，打造亮點。努力把基地建設成為南京大學在深圳的科研成果轉化基地、科研項目研發基地、南方合作教育培訓基地、高新科技企業孵化基地和國際文化交流基地。